OPEN Repository

Welcome to OPEN - the Repository of Open Scientific Publications, run by the Interdisciplinary Centre for Mathematical and Computational Modelling, University of Warsaw, previously operating as the CeON Repository. The Repository enables Polish researchers from all fields to openly share their articles, books, conference materials, reports, doctoral theses, and other scientific texts.

Publications in the Repository are indexed by the most important search engines and aggregators and downloaded by users worldwide. We invite you to create an account, deposit your publications, and use the resources of the Repository.

23113 archived items

Institutional Communities

Recent Submissions

No Thumbnail Available
Item
Computational synthesis design for controlled degradation and revalorization
(Nature Publishing Group, 2024) Żądło-Dobrowolska, Anna; Molga, Karol; Kolodiazhna, Olga O.; Szymkuć, Sara; Moskal, Martyna; Roszak, Rafał; Grzybowski, Bartosz A.; Institute of Organic Chemistry, Polish Academy of Sciences; Allchemy, Highland, IN, USA; IBS Center for Algorithmic and Robotized Synthesis (CARS), Ulsan, South Korea; Department of Chemistry, UNIST, Ulsan, South Korea
Degradation of larger and undesired or harmful molecules into smaller and, ideally, value-added products is one of the most important facets of circular chemistry. However, this task may be cumbersome for chemists who are accustomed to planning syntheses using bond-forming, rather than bond-breaking, methodologies. This work describes a forward-synthesis algorithm that can guide such degradation-oriented analyses. This algorithm uses a broad knowledge-base of degradative and related reactions and applies them to arbitrary small-molecule feeds to generate large synthetic networks within which it then traces degradative pathways that are chemically sound and lead to value-added products. Predictions of the algorithm are validated by proof-of-concept experiments entailing degradation and revalorization of two biomass feeds, d-glucose and quinine.
No Thumbnail Available
Item
Diversity-Oriented Chiral Phosphoric Acid Catalyzed Alkylation of Indolizines with Aminals
(The Royal Society of Chemistry, 2024) Kassir, Ahmad Farouk; Rad, Nazar; Klochowicz, Patryk; Granda, Jaroslaw Marek; Instytut Chemii Organicznej PAN, Warszawa, Polska
Innovations in the pharmaceutical industry and material science drive the need for creating enantiomerically pure heterocyclic molecules with greater complexity and diversity. This study presents methodology to control enantioselective alkylation of indolizines with aminals catalysed by chiral phosphoric acids (CPA), leading to protected indolizylamines achieved in three distinct processes by precise adjustment of reaction conditions. This chemistry can be conducted with excellent enantioselectivity and good yields at both the C1 and C3 position of indolizine. These transformations are scalable and exhibit good functional groups tolerance. The linear free-energy relationship between the property of the catalysts (% buried volume) and alkylation selectivity is demonstrated and a stereoselection model is proposed.
No Thumbnail Available
Item
V4 Medical Simulation Centers Best Practices
(Uczelnia Łazarskiego, 2024) Dąbrowski, Marek
The publication is dedicated to teachers, trainers and medical simulation center technicians committed to the ongoing development of medical training of students and healthcare professionals through medical simulation education. Four state-of-the-art medical simulation centers from the Visegrad region share their the best practices that are among the top available educational techniques and technologies. These include Body InteractTM (described in Chapter 1) applied by the Centre of Simulator and Virtual Medicine at the Faculty of Medicine at Pavol Jozef Šafárik University in Košice. This technology is a student-centered self-directed learning approach that allows students and healthcare professionals to practice simulated real-life clinical scenarios in their own time and at their own pace. In Chapter 2, the University of Szeged Clinical Skills Center describes the SBAR Technique for teaching the highly necessary but often neglected interpersonal skills crucial in emergency departments and during changing shifts at hospitals. The Clinical Skills Center also reveals the fascinating world of microsurgery, its prestigious labs and simulation-based surgery curriculum for professionals. The Simulation Centre of the Faculty of Medicine of Masaryk University -largest and leading medical simulation center in Europe and the Visegrad region -shares in Chapter 3 its tested and proven simulation-based curriculum. Chapter 3 is a very practical and comprehensive instructions manual in how to implement and achieve the best learning outcomes through simulation-based education. The last chapter introduces a new type of medical simulation methodology called the Standardized Patient (SP) that involves an amateur actor who plays the role of a patient. The MedExcellence Medical Simulation Center staff and trainers show how introducing SP into Lazarski University’s medical program benefits soft skills training among future healthcare providers. The interaction with a ‘live’ patient adds both realism and honesty to the educational experience because students receive genuine feedback from the amateur actor/patient. The best practices described in this publication were first presented and discussed during study visits and multiplier events that took place at each medical simulation center as part of the V4 Network of Medical Simulation Centers: Building Best Practices project sponsored by the Visegrad Fund.
Thumbnail Image
Item
Nowe spojrzenie na pałac biskupów płockich w Broku
(Instytut Sztuki Polskiej Akademii Nauk, 2023-10-18) Lasek, Piotr; Związek, Tomasz; Wółkowski, Wojciech; Instytut Sztuki, Polska Akademia Nauk; Instytut Geografii i Przestrzennego Zagospodarowania, Polska Akademia Nauk; Wydział Architektury Politechniki Warszawskiej
Problematykę biskupiego pałacu czy też willi w Broku podejmowano w licznych opracowaniach. Niemal całkowite zniszczenie zabytku utrudniało jednak prowadzenie pogłębionych badań nad jego pierwotną architekturą i zdefiniowanie kręgu potencjalnych budowniczych. Funkcja budowli oraz jej nazewnictwo również pozostawało niejasne, ponieważ w niektórych materiałach określano ją jako zamek. Na podstawie dokumentacji wizualnej i dotychczas nieznanych oraz niewykorzystanych źródeł pisanych przedstawiono w artykule nowe ustalenia na temat architektury pałacu, umożliwiające jego pełną rekonstrukcję. Ustalenia te nie tylko uzupełniają w istotny sposób historię budowy, ale też otwierają interesujące perspektywy badawcze dotyczące kwestii genezy stylistycznej, wykonawstwa, funkcji, znaczenia, wreszcie miejsca, jakie pałac zajmował w architekturze rezydencjonalnej Polski 1. ćwierci XVII stulecia.
Thumbnail Image
Item
Indeks dekoncentryczności przyrostów rocznych drzew – narzędzie do identyfikacji współczesnych ruchów osuwiskowych
(Polskie Towarzystwo Geograficzne, 2011) Wistuba, Małgorzata; Malik, Ireneusz; Katedra Paleogeografii i Paleoekologii Czwartorzędu, Wydział Nauk o Ziemi, Uniwersytet Śląski
Zbadano kształty pni oraz szerokości przyrostów rocznych świerków (Picea abies) porastających stoki osuwiskowe w Moravskoslezských Beskydach (Karpaty Zachodnie, Czechy). W przeciwieństwie do drzew na stokach stabilnych są one pochylone w kierunku dostokowym w górnych częściach stoków, a w częściach dolnych (strefie oddziaływania erozji fluwialnej) – wygięte odstokowo. Po dolnej stronie pni, pod wpływem grawitacji, wytwarzane są szersze przyrosty roczne – drzewa wzrastają dekoncentrycznie. Początkowe lata dekoncentryczności utożsamiono z inicjacją/ reaktywacją procesów osuwania. W celu ich dendrochronologicznego datowania wykorzystano opracowany przez autorów indeks dekoncentryczności przyrostów rocznych (%) oraz zmienność roczną indeksu dekoncentryczności (%). Wskaźniki pozwalają porównywać intensywność ruchów masowych między poszczególnymi drzewami, stanowiskami i osuwiskami. W przeciwieństwie do dotychczasowych metod analizy dekoncentryczności, datowanie czasu osuwania przeprowadzono matematycznie w oparciu o progi obliczone dla stoku referencyjnego.

Browse by

Selected filters:
 Reset filters