Klasyfikacja problemów asemblacji i sekwencjonowania peptydów
Loading...
klasyfikacja.pdf (163.59 KB)
Date
2012-09
Journal Title
Journal ISSN
Volume Title
Publisher
Wydawnictwo Pracowni Komputerowej Jacka Skalmierskiego
Using this material is possible in accordance with the relevant provisions of fair use or other exceptions provided by law. Other use requires the consent of the holder.
Abstract
Sekwencjonowanie peptydów polega na ustaleniu kolejności aminokwasów (sekwencji) w cząsteczce. Bezpośrednie metody chemii analitycznej pozwalają˛na określenie jedynie krótkich sekwencji. Alternatywa˛dla tych metod jest spektrometria masowa. Widmo masowe powstałe w wyniku przeprowadzenia eksperymentu za pomocą spektrometru wymaga dodatkowej analizy. Z punktu widzenia nauk obliczeniowych analiza takiego widma jest źródłem ciekawych problemów. Ta metoda sekwencjonowania posiada swoje ograniczenia co do długości sekwencji. Rodzi to naturalna˛ potrzebę projektowania metod asemblacyjnych, które pozwolą połączyć wiele krótkich łańcuchów w oryginalna˛cząsteczkę. W pracy tej przedstawiono problemy sekwencjonowania i asemblacji oraz zaproponowano ich klasyfikacje˛. Przedstawiono również wybrane metody rozwiązujące te problemy.
Description
Citation
Kozak, A., Głowacki, T., Formanowicz, P. (2012). Klasyfikacja problemów asemblacji i sekwencjonowania peptydów. W: A. Swierniak, J. Krystek (red.).Automatyzacja Procesów Dyskretnych, Teoria i Zastosowania. Gliwice: Wydawnictwo Pracowni Komputerowej Jacka Skalmierskiego.