Klasyfikacja problemów asemblacji i sekwencjonowania peptydów

Abstract
Sekwencjonowanie peptydów polega na ustaleniu kolejności aminokwasów (sekwencji) w czasteczce. Bezpośrednie metody chemii analitycznej pozwalaja˛na określenie jedynie krótkich sekwencji. Alternatywa˛dla tych metod jest spektrometria masowa. Widmo masowe powstałe w wyniku przeprowadzenia eksperymentu za pomoca˛ spektrometru wymaga dodatkowej analizy. Z punktu widzenia nauk obliczeniowych analiza takiego widma jest źródłem ciekawych problemów. Ta metoda sekwencjonowania posiada swoje ograniczenia co do długości sekwencji. Rodzi to naturalną potrzebę projektowania metod asemblacyjnych, które pozwolą połączyć wiele krótkich łańcuchów w oryginalną czasteczkę. W pracy tej przedstawiono problemy sekwencjonowania i asemblacji oraz zaproponowano ich klasyfikację. Przedstawiono również wybrane metody rozwiązujące te problemy.
Description
Citation
Kozak, A. Głowacki, T., Formanowicz, P. (2012). Klasyfikacja problemów asemblacji i sekwencjonowania peptydów. W: A. Świerniak, J. Krystek (red.). Automatyzacja procesów dyskretnych: teoria i zastosowania. T. 2. Gliwice: Wydawnictwo Pracowni Komputerowej Jacka Skalmierskiego
Related research dataset
Belongs to collection